[xabbuh]

Grundsätzlich ist es möglich zwei unterschiedliche MySQL-Versionen laufen zu lassen, so lange du getrennte Verzeichnisse für die beiden Versionen verwendest. Wenn du die Installation über die Paketverwaltung vornimmst, dürfte diese Trennung automatisch passieren (möglicherweise musst du noch die Pfade für Logfiles und das Datenverzeichnis anpassen). Falls du MySQL selbst kompilierst, müsstest du eben die entsprechenden Schalter beim Konfigurieren setzen.

Anschließend müsstest du dann noch die beiden Server so konfigurieren, dass beide auf unterschiedlichen IP-Adressen lauschen bzw. ein Server an den IP-Adressen und ein Server am UNIX-Socket.