Was willst du denn machen? In PDFs stellt phpMyAdmin doch nur die Tabellenbeziehungen dar, soweit ich weiß.. Was willst du damit? Ein Backup kannst du mit
mysqldump gut machen, wenn dein Provider das zulässt, die Datei kannst du über readfile dann auch an den Client geben..
http://dev.mysql.com/doc/en/mysqldump.html