[DokuLeseHemmung]

Ein Apache und das darin laufende PHP darf niemals die Rechte haben die Apache Konfiguration zu lesen und zu schreiben. Im Falle eines gelungenen Angriffs wäre das Einfallstor einfach zu groß. Zuviel Macht.

Desweiteren wird dein Script ja den Apache restarten. In dem Augenblick wird auch das Script gekillt. Ist doch logisch, oder?

Gängige Administrationsysteme verwenden einen mit ausreichenden Rechten laufenden Dienst/Daemon um sowas zu erledigen.